Certifikáty jsou obvykle vystavovány konkrétnímu počítači, uživateli nebo službě pro konkrétní účely, na konkrétní dobu a často pro konkrétní příjemce. Časem proto bude možná třeba získat další certifikáty, obnovit stávající certifikáty, zkontrolovat nebo změnit vlastnosti certifikátu nebo certifikáty přesunout. Ačkoli mnoho těchto úkolů je možné provádět pro jednotlivého uživatele, počítač nebo službu, u některých úkolů je vhodné, aby je provedl správce automaticky prostřednictvím serveru. V následujících částech jsou popsány běžné úkoly správy certifikátů a postup při jejich provádění.