Varmenteet myönnetään yleensä tietylle tietokoneelle, käyttäjälle tai palvelulle, tiettyyn tarkoitukseen, määräajaksi ja usein tietyille vastaanottajille. Tämän takia joskus on tarpeen saada lisävarmenteita, uusia nykyisiä varmenteita, tarkastella tai muokata varmenteen ominaisuuksia tai siirtää varmenteita. Vaikka yksittäinen käyttäjä, tietokone tai palvelu voi suorittaa monia näistä tehtävistä, toiset ovat luonteeltaan sellaisia, että järjestelmänvalvojan on paras tehdä ne automaattisesti palvelimesta käsin. Seuraavissa jaksoissa kuvataan yleisiä varmenteiden hallintatehtäviä ja annetaan menettelyohjeita.