Jednostka organizacyjna jest szczególnie przydatnym typem obiektu katalogu w domenach. Jednostki organizacyjne są kontenerami usługi Active Directory, w których można umieszczać użytkowników, grupy, komputery i inne jednostki organizacyjne. Jednostka organizacyjna nie może zawierać obiektów z innych domen.
Jednostka organizacyjna jest najmniejszym zakresem, do którego można przypisywać ustawienia zasad grupy lub delegować uprawnienia administracyjne. Za pomocą jednostek organizacyjnych można tworzyć w domenie kontenery reprezentujące hierarchiczne struktury logiczne w organizacji. Dzięki temu można zarządzać konfiguracją oraz korzystać z kont i zasobów zgodnie z modelem organizacji.
Jednostki organizacyjne mogą zawierać inne jednostki organizacyjne. Hierarchię jednostek organizacyjnych można w razie potrzeby rozszerzyć w celu dopasowania jej do hierarchii organizacji wewnątrz domeny. Zastosowanie jednostek organizacyjnych ułatwia minimalizację liczby domen wymaganych w danej sieci.
Jednostki organizacyjne umożliwiają utworzenie modelu administracyjnego, który można skalować bez ograniczeń. Określony użytkownik może mieć uprawnienia administracyjne dla wszystkich jednostek organizacyjnych w domenie lub dla pojedynczej jednostki organizacyjnej. Administrator jednostki organizacyjnej nie musi mieć uprawnień administracyjnych dla pozostałych jednostek organizacyjnych w domenie.